Ранние поселения на территории Висбадена относятся к эпохе неолита. Горячие источники известны со времен Римской империи — первое известное упоминание относится к 77 году н. э. в «Естественной истории» Плиния Старшего. Место называлось тогда «Aquae Mattiacorum» (русск. Источники Маттиаков) по имени проживавшего в этих местах дружественного римлянам хаттского племени.

В 260 году крепость заняли алеманны. В 370 году римляне и алеманны объединились, за алеманнами было закреплено право на Висбаден, и они должны были участвовать в защите Римской империи от других германских племён. В 496 году алеманны были покорены Хлодвигом и присоединены к Франкскому государству. В VIII веке франки построили Королевский Двор. Между 828 и 830 годами Эйнхард упоминает название «Висбада». Это было первое историческое упоминание Висбадена под современным названием.

В 1170-е герцогство Нассау получило Висбаден во владение и правило городом до 1242 года, пока архиепископ Майнц не занял город и не сжёг его. Висбаден снова стал частью Нассау в 1270 году. В 1329 дом Нассау и Висбаден получили право чеканить монету от короля Людовика IV Баварского. Из-за участия в Крестьянской Войне Висбаден утратил все привилегии в 1525 году на сорок лет. За это время город стал протестантским центром, первым лютеранским пастором был Вольф Дентенер с 1 января 1543 года. В 1566 году городу вернули привилегии. Самое старое здание города — ратуша, которая строилась с 1609 по 1610 год. Пожары города 1547 и 1561 годов привели к разрушению старых зданий.

В 1815 году столица Нассау была перенесена в Висбаден, и в городе возникла резиденция герцога. С этого времени город стал активно обстраиваться и приобретать величественный вид. В 1866 году во время Австро-прусской войны Нассау приняло сторону Австрии. Поражение Австрии в войне привело к ликвидации герцогства и аннексии Нассау прусскими войсками. Возникла прусская провинция Гессен-Нассау.

После Второй мировой войны по инициативе США была организована земля Гессен и Висбаден стал столицей. Американские войска присутствуют в Висбадене до сих пор, несколько дивизий дислоцированы при выезде из города в сторону Франкфурта. Кроме того, здесь располагается Федеральное ведомство уголовной полиции Германии.

Дворцовая площадь (нем. Schlossplatz), на которой находятся герцогский дворец, построенный Вильгельмом, герцогом Нассау в 1840 году и Новая ратуша (1887 год). Старая ратуша, построенная в 1610 году, является самым старым зданием города. Церковь Маркткирхе (нем. Marktkirche), построенная в 1852—1862 годах в неоготическом стиле. Её западная башня высотой 92 метра делает церковь самым высоким зданием в городе. Русский храм святой Елисаветы («Греческая капелла») сооружён в 1848—1855 годах, на горе Нероберг в память о безвременно ушедшей из жизни герцогине Нассау, российской Великой Княгине Елизавете Михайловны.

Университет прикладных наук Висбадена (нем. Fachhochschule Wiesbaden).